香港人口密度居世界前列，為應付潛在的大型傳染病爆發危機，醫管局在瑪嘉烈醫院設立全港首間傳染病中心，並委託署方衞生工程部為中心各項電子系統工程提供策劃服務，及就機電和空調系統之設計，提供維修保養方面的意見。而日後的維修保養及操作，亦由該部負責。

謹慎細密的工作態度，加上駐院工程隊伍對醫院運作模式的熟悉，讓工程得以順利完成。中心已於2007年6月22日由國家衞生部部長高強先生與衞生福利局局長周一嶽先生主持開幕儀式，而本署副署長/營運服務黃達平先生及署理助理署長/工程服務二蔡國權先生亦親臨參與，見證中心投入服務。